给司徒王导说：“温太真才离开几天，就做出这样的事！应当悬赏捉拿他，我要亲自拔掉他的舌头。”

明帝准备讨伐王敦，询问光禄勋应詹，应詹鼓励促成此事，明帝于是下定决心。丁卯日，加授司徒王导为大都督、兼扬州刺史，任命温峤都督东安北部诸军事，与右将军卞敦守卫石头城，应詹任护军将军、都督前锋及朱雀桥南诸军事，郗鉴代理卫将军、都督扈从皇帝诸军事，庾亮兼任左卫将军，任命吏部尚书卞壸代理中军将军。郗鉴认为军号无益于实际，坚决推辞不接受，请求召来临淮太守苏峻、兖州刺史刘遐共同讨伐王敦。明帝下诏征召苏峻、刘遐以及徐州刺史王邃、豫州刺史祖约、广陵太守陶瞻等人入京守卫。明帝驻屯在中堂。

司徒王导听说王敦病重，带领子弟们为王敦发丧（以迷惑对方），大家以为王敦真的死了，都斗志昂扬。于是尚书省传送诏书到王敦的军府，罗列王敦的罪恶说：“王敦擅自立兄长的儿子继承自己的职位，从来没有宰相的继承人不由王命任命的。顽劣凶恶之徒互相怂恿，毫无顾忌；志向在于放纵凶恶丑类，企图篡夺皇位。上天不助长奸恶，王敦因而毙命；钱凤继承凶逆，更加煽动叛乱。现今派遣司徒王导等率领猛虎般的军队三万人，分十路并进；平西将军王邃等率领精锐部队三万人，水陆齐进；朕亲自统领各路军队，讨伐钱凤的罪行。有能杀死钱凤送上首级的，封五千户侯。各级文武官员凡是被王敦任用的，一概不予追究，不要猜疑忌惮，以免自取毁灭。王敦的将士们，跟随王敦多年，远离家乡，朕非常怜悯。家中是独子的，一律遣返回家，终身不再征调；其余的人都给予三年假期，假期结束后回到朝廷，将与宿卫官兵一样轮番值勤（三番制）。”

王敦见到诏书，非常愤怒，但病情更加严重，不能亲自带兵；他准备起兵攻打京师，让记室郭璞占卜，郭璞说：“不会成功。”王敦一向怀疑郭璞帮助温峤、庾亮，等到听说是凶卦，就问郭璞：“你再算算我的寿命有多长？”郭璞说：“根据刚才的卦象，明公如果起事，灾祸不久就会来临。如果退回武昌，寿命则不可预测。”王敦大怒说：“你的寿命有多长？”郭璞说：“我的命今天就到正午时分结束。”王敦于是逮捕了郭璞，将他斩首。

王敦派钱凤以及冠军将军邓岳、前将军周抚等人率领军队向京师进发。王含对王敦说：“这是我们的家事，我应当亲自去。”于是王敦任命王含为元帅。钱凤等人问道：“事情成功之日，天子该怎么处置？”王敦说：“还没有南郊祭天，怎么能称天子！只管用尽你们的兵力，保护东海王（司马冲）和裴妃就是了。”（意即另立新君）。于是上疏，以诛杀奸臣温峤等人为名。秋季，七月，壬申朔（初一），王含等人的水陆军五万人突然到达江宁南岸，京城人心惶惶。温峤移兵驻扎在水北，烧毁了朱雀桁（朱雀桥）来挫败叛军的锐气，王含等人无法渡河。明帝本想亲自率领军队出击，听说桥已被烧断，大为恼怒。温峤说：“如今宿卫兵力弱小，征召的援军未到，如果让敌人横冲直撞，将会危及国家社稷，连宗庙恐怕都保不住了，何必吝惜一座桥呢！”

司徒王导送给王含一封信说：“近来得知大将军病重，有人说已经去世。不久知道钱凤大肆戒严，想肆行奸逆；认为兄长您应当抑制他的不轨之心，返回武昌藩镇，如今却与这些犬羊之辈一同东下。兄长的这一举动，认为能像大将军往年那样（成功）吗？往年佞臣扰乱朝政，人心不安，像我们这些人，都想着借助外援（指王敦）。如今则不然。大将军驻屯于湖以来，逐渐失去人心，君子感到危险恐惧，百姓疲惫困苦。临终之时，将重任交给安期（王应字）；安期断奶才几天？再论时望，难道可以继承宰相的位子吗？自从开天辟地以来，可有让小孩子做宰相的吗？凡是有耳朵的人，都知道这将会是禅代（篡位），不是人臣该做的事。先帝中兴晋朝，遗留的恩惠仍在民间；当今圣主聪明睿智，恩德遍及朝野。兄长却想妄生叛逆之心，凡是人臣，谁不愤慨叹息！我王导一家大小蒙受国家厚恩，今日之事，我会明目张胆，作为六军的先锋，宁可做忠臣而死，绝不做无赖而活！”王含没有回复。

有人认为“王含、钱凤的兵力是我们的百倍，苑城（台城）小而不够坚固，应该趁敌军阵势未成，陛下亲自出兵迎战”。郗鉴说：“那群叛逆纵欲放荡，势头不可阻挡，可以用计谋使他们屈服，难以用武力硬拼。况且王含等人号令不统一，士兵抢劫盗窃不断，官吏百姓鉴于往年他们暴虐抢掠，都会人人各自为守。我们凭借顺逆的形势，何愁不能攻克敌人！而且叛军没有长远的谋略