处、振武将军沈田子率领三千人从海路袭击番禺（今广东广州，卢循的老巢）。沈田子，是沈林子的哥哥。众人都认为 “海路艰难遥远，难以到达，而且分走现有兵力，不是当前紧急的事”。刘裕不听，命令孙处说：“大军在十二月初一定能击败妖虏，你到那时要先摧毁他们的巢穴，让他们逃跑后无处可归。”

谯纵派侍中谯良等人前往后秦朝见，请求出兵讨伐晋朝。谯纵任命桓谦为荆州刺史，谯道福为梁州刺史，率领二万人侵犯荆州；后秦王姚兴派前将军苟林率领骑兵与他们会合。

江陵自从卢循东下后，就得不到建康的消息，盗贼四处兴起。荆州刺史刘道规派司马王镇之率领天门太守檀道济、广武将军彭城人到彦之入援建康。檀道济，是檀祗的弟弟。

王镇之抵达寻阳时，被苟林击败。卢循听说后，任命苟林为南蛮校尉，分给他兵力，让他乘胜讨伐江陵，还声称徐道覆已经攻克建康。桓谦在路上招募旧部和义士，投奔他的百姓有二万人。桓谦驻守枝江（今湖北宜昌枝江），苟林驻守江津（今湖北荆州江陵南），两个敌寇逼近江陵，江陵的官民大多怀有二心。刘道规于是召集将士说：“桓谦现在就在附近，我听说各位中有不少人有离开的打算。我从东边带来的文武官员，足够办成大事；如果有人想走，我绝不禁止。” 于是夜里打开城门，直到天亮都不关闭。众人都敬畏服从，没有一个人离开。

雍州刺史鲁宗之率领几千人从襄阳（今湖北襄阳）赶赴江陵。有人说鲁宗之的心意难以揣测，刘道规却单人匹马前去迎接他，鲁宗之深受感动，十分喜悦。刘道规让鲁宗之留守江陵，把他当作心腹托付，自己则率领各路军队进攻桓谦。将领们都说：“现在远出讨伐桓谦，胜负难料。苟林近在江津，窥探我们的动静，如果他来攻城，鲁宗之未必能守住；万一失利，大事就全完了。” 刘道规说：“苟林愚蠢懦弱，没什么奇计，他知道我离开不远，一定不敢攻城。我现在去进攻桓谦，到了就能攻克；等他犹豫要不要来的时候，我已经返回了。桓谦战败后，苟林会吓破胆，哪有时间来攻城！而且鲁宗之单独防守，怎么会支撑不了几天！” 于是快速进军攻打桓谦，水路、陆路同时推进。桓谦等人大规模部署水军，加上步兵、骑兵，在枝江交战。檀道济率先冲锋，攻破敌阵，桓谦等人大败。桓谦独自驾船逃奔苟林，刘道规追击，将他斩杀。返回时，刘道规抵达涌口（今湖北荆州江陵东南），讨伐苟林，苟林逃跑，刘道规派咨议参军临淮人刘遵率领部众追击。当初，桓谦抵达枝江时，江陵的官民都给桓谦写信，告知城内虚实，想做内应；这时这些信被查获，刘道规却全部烧掉，看都不看，众人于是彻底安心。

江州刺史庾悦任命鄱阳太守虞丘进为先锋，多次击败卢循的军队，进军占据豫章（今江西南昌），断绝了卢循的粮道。九月，刘遵在巴陵（今湖南岳阳）斩杀苟林。

桓石绥趁卢循入侵之机，在洛口（今湖北襄阳东南）起兵，自称荆州刺史；征阳县令王天恩自称梁州刺史，袭击并占据西城（今陕西安康西北）。梁州刺史傅韶派儿子魏兴太守傅弘之讨伐桓石绥等人，将他们全部斩杀，桓氏家族从此灭亡。傅韶，是傅畅的孙子。

西秦王乞伏乾归进攻后秦的略阳（今甘肃天水秦安）、南安（今甘肃定西陇西东南）、陇西（今甘肃定西临洮）等郡，全部攻克，把二万五千户百姓迁徙到苑川和枹罕（今甘肃临夏）。

甲寅日（九月十九日），北魏将拓跋珪安葬在盛乐金陵（今内蒙古呼和浩特和林格尔西北），谥号为 “宣武”，庙号为 “烈祖”。

刘毅坚决请求追击卢循，长史王诞秘密对刘裕说：“刘毅已经战败，不宜再让他立功。” 刘裕听从了王诞的建议。冬季，十月，刘裕率领兖州刺史刘籓、宁朔将军檀韶、冠军将军刘敬宣等人向南进攻卢循，任命刘毅监管太尉留府事务，后方的所有事情都委托给他。癸巳日（二十九日），刘裕从建康出发。

徐道覆率领三万人赶赴江陵，突然抵达破冢（今湖北荆州江陵东南）。当时鲁宗之已经返回襄阳，来不及召回，江陵人心大为震动。有人传言卢循已经平定京城，派徐道覆来当荆州刺史，但江汉地区的官民感激刘道规之前焚烧书信、不追究内应的恩德，没有再怀二心。刘道规让刘遵另外率领一支游军（机动部队），自己在豫章口（今湖北荆州江陵东南）抵抗徐道覆，先锋部队失利；刘遵从外围侧面袭击，大败贼军，斩首一万多级，贼军投水而死的几乎全部灭绝。徐道覆独自驾船逃回湓口（今江西九江东）。当初，刘道规让刘