姚赞带领家族一百多人前往刘裕处投降，刘裕把他们全部杀了。把姚泓押送到建康，在街市上斩首。刘裕任命薛辩为平阳太守，让他镇守防卫北方边境。

刘裕商议迁都洛阳，谘议参军王仲德说：“迁都这样不寻常的事情，本来就不是普通人能接受的，必定会导致人心惶惶。如今军队在外征战时间太长，士兵们思念家乡，迁都的计划，不可商议。” 刘裕于是停止了这个想法。

羌族部众十多万人向西逃往陇山地区，沈林子追击到槐里，俘虏了数以万计的人。

河西王沮渠蒙逊听说太尉刘裕消灭了后秦，非常愤怒。门下校郎刘祥入宫奏事，沮渠蒙逊说：“你听说刘裕进入关中，竟敢对群臣说：‘姚泓不是刘裕的对手。而且他的兄弟内部叛乱，怎么能抵抗别人！刘裕夺取关中是必定的。但刘裕不能长期留在关中，一定会南归，留下子弟和将领驻守，我夺取关中就像捡起小草一样容易。’” 于是沮渠蒙逊喂饱战马、磨利兵器，训练士兵，进军占据安定，秦岭以北的郡县和守军都向他投降。刘裕派遣使者给赫连勃勃送信，约定结为兄弟；赫连勃勃让中书侍郎皇甫徽写回信，却暗中构思精彩的文辞，面对刘裕的使者，口头授意舍人写下回信。刘裕读了这封信，感叹说：“我不如他啊！”

广州刺史谢欣去世，东海人徐道期聚集部众攻克广州城，进攻始兴郡，始兴相、彭城人刘谦之讨伐诛杀了徐道期。朝廷下诏任命刘谦之为广州刺史。

癸酉日，司马休之、司马文思、司马国璠、司马道赐、鲁轨、韩延之、刁雍、王慧龙以及桓温的孙子桓道度、桓道子、同族人桓谧、桓璲、陈郡人袁式等人，都前往北魏长孙嵩处投降。后秦匈奴镇将姚成都及其弟弟姚和都献出镇守的城池投降北魏。北魏国主拓跋嗣下诏：民间有人抓获姚氏家族子弟并送到平城的，给予赏赐。冬季，十月，己酉日，拓跋嗣征召长孙嵩等人返回平城。司马休之不久后在北魏去世。北魏赏赐司马国璠淮南公爵位，司马道赐池阳子爵位，鲁轨襄阳公爵位。刁雍上表请求到南方边境为北魏效力，拓跋嗣任命刁雍为建义将军。刁雍在黄河、济水之间聚集部众，骚扰徐州、兖州；太尉刘裕派遣军队讨伐他，却没能攻克，刁雍进军驻守固山，部众达到两万人。

朝廷下诏将宋公刘裕的爵位晋升为王，增加赏赐十个郡的封地；刘裕推辞不接受。

西秦王乞伏炽磐派遣左丞相昙达等人进攻后秦旧将姚艾，姚艾派遣使者向乞伏炽磐称臣，乞伏炽磐任命姚艾为征东大将军、秦州牧。征召王松寿担任尚书左仆射。

十一月，北魏叔孙建等人讨伐西山丁零部落的翟蜀洛支等人，平定了他们。

辛未日，刘穆之去世。太尉刘裕听说后，震惊悲痛、哀伤惋惜了好几天。起初，刘裕想留在长安，谋划治理西北地区，但各位将领和僚属都因长期征战思念家乡，大多不愿意留下。恰逢刘穆之去世，刘裕认为京城的根基没有可靠的人托付，于是下定决心东归。

刘穆之去世后，朝廷上下恐惧不安，想下诏任命太尉左司马徐羡之代替刘穆之的职位，中军咨议参军张邵说：“如今确实是紧急情况，最终的人选还是徐羡之；但世子（刘义符）没有擅自发号施令的权力，应当先咨询刘裕。” 刘裕想任用王弘代替刘穆之，从事中郎谢晦说：“王弘（字休元）性情轻率，不如徐羡之可靠。” 于是任命徐羡之为吏部尚书、建威将军、丹阳尹，代理掌管留守事务。于是过去朝廷中常常由刘穆之决定的大事，现在都派人到北方刘裕的军中咨询。

刘裕任命次子桂阳公刘义真为都督雍、梁、秦、凉四州诸军事、安西将军，兼任雍州、东秦州刺史。刘义真当时年仅十二岁。任命太尉咨议参军、京兆人王修为长史，王镇恶为司马、兼任冯翊太守，沈田子、毛德祖都担任中兵参军，又任命沈田子兼任始平太守，毛德祖兼任秦州刺史、天水太守，傅弘之为雍州治中从事史。

在此之前，从陇山地区流亡到关中居住的人，希望凭借刘裕的军威回到家乡；等到刘裕设置东秦州，人们知道刘裕没有再向西进军的意图，都叹息失望。

关中人一向敬重王猛（前秦名相，深受关中百姓爱戴），刘裕攻克长安，王镇恶的功劳最大，因此刘裕手下的南方将领都嫉妒他。沈田子自认为有峣柳之战的战功，与王镇恶争夺功劳，心怀不满。刘裕将要东归，沈田子和傅弘之多次对刘裕说：“王镇恶的家在关中，不可信任。” 刘裕说：“如今留下你们这些文武将领和一万精锐士兵，他如果想做坏事，正好足以让他自取灭亡。不要再多说了。”